事業(yè)單位在轉制、改制過程中，應該按照以下操作方法來進行：
一、依法開展改制單位的清產(chǎn)核資工作
在事業(yè)單位轉制、改制過程中，堅持公有資產(chǎn)保值增值是一項基本原則。要依法維護國家、集體所有者的合法權益，就必須規(guī)范整個清產(chǎn)核資的操作程序。事業(yè)單位自身的資產(chǎn)產(chǎn)權界定、資產(chǎn)評估本身就是一個十分敏感而又引人關注的問題，特別是有些事業(yè)單位由于歷史的原因，擁有的資產(chǎn)數(shù)額十分龐大，這個問題就更加突出。因此如何保證清產(chǎn)核資工作的順利進行，防止某些人利用改制、轉制之機，以各種非法手段侵吞公有資產(chǎn)，是擺在各級領導面前的一個必須認真對待的問題。我們認為，只有加強法律監(jiān)督和控制，才能有效的保證清產(chǎn)核資工作的正常開展。
第一、改制單位的上級主管部門應加強對清產(chǎn)核資工作的指導和監(jiān)督，在改制單位申請資產(chǎn)評估立項后，由主管部門委托具有資質的中介機構對改制單位進行資產(chǎn)評估。
第二、對涉及到改制單位產(chǎn)權界定、產(chǎn)權交易、資產(chǎn)處置方案的制訂、改制單位的股權結構設置、資產(chǎn)轉讓等行為，應由律師出具法律意見書，確保整個改制、轉制流程的合法性。
第三、加強民主監(jiān)督，資產(chǎn)的評估結果、處置方案等須交由職工大會審議。
第四、對發(fā)生在轉制過程中的違法犯罪行為必須依法處理。對于在轉制、改制過程中隱匿資產(chǎn)的行為，一經(jīng)發(fā)現(xiàn)，就要依法追究當事人法律責任。對于中介機構在承辦業(yè)務時，同改制單位串通作弊、弄虛作假或隱瞞不報，出現(xiàn)重大疏漏、嚴重誤導等導致國有資產(chǎn)重大流失、侵害其他產(chǎn)權主體合法權益的，也應依法追究責任。
二、改制方案的制定要堅持“三公”原則和職工民主管理
同國有企業(yè)改制一樣，事業(yè)單位在改制過程中涉及的改制、轉制方案的制訂實施應堅持公開、公平、公正的原則，必須事先將改制方案提交職工(代表)大會審議通過。這既是在政治上保證職工群眾的主人翁地位，調(diào)動廣大職工的積極性和創(chuàng)造性，也是在制度上落實職工群眾參與民主管理、民主監(jiān)督。如果這項工作做得不好，往往會影響改制的正常進行，甚至還會給社會帶來不穩(wěn)定的因素。
第一、應做好單位職工的思想工作，讓職工群眾真正理解改制的內(nèi)涵，使他們主動參予到改制過程中來，保證改制工作的順利進行。
第二、應依法召開職工(代表)大會，對于清產(chǎn)核資的結果、改制方案等交由職工大會做成規(guī)范的決議。
第三、在改制過程中切實注意保護職工的合法權益，對涉及職工切身利益的決定應交由工會和職工大會討論并形成決議。
三、根據(jù)單位不同情況決定企業(yè)形式
由于事業(yè)單位具有分布較廣、類型復雜等特點，在轉制、改制過程中不能就改制單位的形態(tài)進行“一刀切”，而是要根據(jù)各個單位的不同特點來決定其改制的形式;從改制單位的股權設置角度來說，也不能片面強調(diào)國有資本全部退出，而要根據(jù)各單位的不同情況，在鼓勵經(jīng)營者持大股的前提下，有選擇的保留部分國有股份。
根據(jù)大多數(shù)事業(yè)單位的實際情況，按照現(xiàn)代企業(yè)制度的要求，改制為有限責任公司是一種常見的做法。有限責任公司具有注冊資本要求較低、設立程序簡單、出資方式靈活、治理結構設置靈活、改制成本低等特點，比較適合于那些參股人數(shù)較少、企業(yè)資產(chǎn)不是很多的企業(yè)。改制成有限責任公司可以從產(chǎn)權制度改革上一步到位，有利于企業(yè)的經(jīng)營層、主要經(jīng)營者和業(yè)務骨干持大股。
股份合作制企業(yè)是我國由計劃經(jīng)濟向市場經(jīng)濟轉軌過程中發(fā)展出來的、獨具中國特色的企業(yè)組織形式。這種組織形式在歷史上具有積極的意義，但總的來說，仍然是向現(xiàn)代企業(yè)制度過渡的一種中間形態(tài)。隨著社會主義市場經(jīng)濟的發(fā)展和企業(yè)規(guī)模的壯大，目前許多股份合作制企業(yè)正走向規(guī)范的股份制。因此，我們認為，除了對那些職工入股愿望強烈、人數(shù)較多的單位外，一般不宜再采用這類組織形式。
對于那些資產(chǎn)規(guī)模大、經(jīng)濟效益好的單位，股份有限公司則是最佳的選擇。在設立股份有限公司時，我們認為有必要保留部分國有股份，同時也應積極吸收社會上的各種投資基金的介入。這樣，既能有效地保證國有資產(chǎn)的保值和增值，也能更深地加強企業(yè)同資本市場的聯(lián)系，使企業(yè)具有更強的生命力。
四、建立完善的企業(yè)治理結構
此次事業(yè)單位改制的總體目標是建立真正自主經(jīng)營、自負盈虧、自我發(fā)展、自我約束的獨立的企業(yè)法人實體，那么在改制過程中就應該按照現(xiàn)代企業(yè)制度的要求來完善企業(yè)的治理結構，保證企業(yè)未來的正常運轉。
在現(xiàn)代企業(yè)制度中，股東會、董事會、監(jiān)事會、經(jīng)理層各司其職、各行其權。然而，我國的國有企業(yè)中普通存在的嚴重“內(nèi)部人控制”、國有股權代表人缺位、董事會與監(jiān)事會監(jiān)督功能弱化等問題，往往容易導致國有資產(chǎn)的流失。因此本次事業(yè)單位改制，在改制企業(yè)的公司治理結構的設置上應注意以下幾點：
第一、依法建立完善的股東會、董事會、監(jiān)事會，制訂具有明確可操作性的企業(yè)章程和議事規(guī)則。這首先從制度上構成了公司治理結構得以順利運行的保證。
第二、在企業(yè)內(nèi)實行決策層和執(zhí)行層的分離。一般來說，應盡量做到企業(yè)董事長、總經(jīng)理分設，限制董事會中的經(jīng)營人員人數(shù)，防止形成“內(nèi)部人控制”的現(xiàn)象。
第三、完善對企業(yè)經(jīng)營者的監(jiān)督機制。企業(yè)的董事會成員中應包含一定數(shù)量的獨立董事，以外部監(jiān)事為監(jiān)事會的主要組成成員，依法加強董事會和監(jiān)事會對經(jīng)營層的監(jiān)督。
五、建立新型內(nèi)部用人制度
事業(yè)單位原有的人事制度并不適合于企業(yè)，因此市政府21號文中提出了要切實創(chuàng)新內(nèi)部用人用工、收入分配機制。
所有單位與職工都要按照國家有關法律、法規(guī)的規(guī)定，在平等自愿、協(xié)商一致的基礎上，通過簽訂勞動合同，明確單位和個人的人事關系和權利義務關系，實現(xiàn)事業(yè)單位人事管理由身份管理向崗位管理轉變，由單純行政管理向法制管理轉變。實行崗位管理制度、按崗聘用、競爭上崗，突破原有的事業(yè)單位國家干部身份制、等級工資制等等。
要建立形式多樣、自主靈活的分配激勵機制也是此次改革的重要內(nèi)容。對于企業(yè)經(jīng)營者，要將短期激勵報酬同長期激勵報酬相結合，可以采取年薪制或股票期權等方式;對于職工，除實行崗績工資制度外，在條件具備的情況下還可以實行職工持股制度，充分調(diào)動職工的積極性。
以上所述只是一般的改制步驟，具體操作流程需要根據(jù)企業(yè)實際情況靈活掌握和調(diào)整運作。如需進一步接洽，請?zhí)峁┠闫髽I(yè)詳細資料直接與改制律師聯(lián)系。
